От стерляди сибирский осетр легко отличается меньшим числом боковых жучек (не более 50), а от русского осетра, к которому он близок, веерообразными жаберными тычинками и более заостренным рылом, полупроходная рыба. Он нагуливается в устьевых пространствах сибирских рек, а для размножения поднимается по ним на многие сотни километров.

Выделяют 4 подвида:

• A. baеrii baеrii Brandt, 1869 - западносибирский осетр (Обский осетр) (Обь, Иртыш);
• A. baеrii stenorrhynchus A.Nikolsky, 1896 - восточносибирский осетр (Длиннорылый осетр) (реки Сибири от Енисея до Хатанги);
• A. baеrii chatys Drjagin, 1948 - якутский осетр (реки Якутии от Хатанги до Колымы);
• A. baеrii baicalensis A.Nikolsky, 1896 - байкальский осетр (Меньшиков, 1947; Дрягин, 1948).

Ленский осетр рассматривается как подвид Байкальского осетра.

Помимо бассейна Оби с Иртышом и Енисея, он встречается дальше на восток, до Колымы, а также в Байкале.

Пищу его составляют разнообразные донные организмы: личинки хирономид, ручейников, поденок, амфиподы, гаммариды. черви, моллюски, реже рыба.

В Красную книгу Российской Федерации внесены байкальский и обь-иртышский подвиды сибирского осетра. Вид занесен в Красную книгу МСОП.